<div dir="ltr">Hi all, <div><br></div><div>I'm beginner of CASToR. I installed CASToR in virtual machine (ubuntu 18.04.2) and compiled CASToR using the provided Makefile.</div><div>After that, I tried to reconstruct example (castor_benchmark_v3_pet_list-mode)</div><div>I got the following error</div><div><br></div><div>[354] 09:23 vgate:~/Desktop/castor_benchmark_v3_pet_list-mode > ./run_benchmark_pet_list-mode_unix.sh<br>==============================================================================================<br>Reconstruction is going on. Should take from one to several minutes depending on the hardware.<br>==============================================================================================<br>sOutputManager::InitOutputDirectory() -> Output path is 'benchmark_pet_list-mode_challenger'<br>castor-recon() -> Launch reconstruction from CASToR version 3.0.1.<br>***** sScannerManager::GetAvailableScanners() -> Could not open the repository directory at: <span style="background-color:rgb(255,255,0)">/usr/share/cern/root-install/bin:/usr/share/geant4/geant4-install/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/snap/bin:/usr/share/gate/Gate-install/bin:/home/gate/castor_v3.0.1/bin:/home/gate/castor_v3.0.1/config/scanner/</span><br>***** sScannerManager::FindScannerSystem() -> A problem occurred while recovering scanner names from the scanner repository !<br>***** castor-recon() -> A problem occurred while searching for scanner system !<br>***** Exit function called. Abort with code 1.<br>==============================================================================================<br>Check benchmark results (compare sensitivity image with the reference one)<br>==============================================================================================<br>***** Input header file 'benchmark_pet_list-mode_challenger_sensitivity.hdr' is missing or corrupted !<br><br>==============================================================================================<br>Check benchmark results (compare reconstructed image with the reference one)<br>==============================================================================================<br>***** Input header file 'benchmark_pet_list-mode_challenger_it2.hdr' is missing or corrupted !<br></div><div><div><br></div><div><br></div><div>How can I clear the error ? Any advice are appreciated.</div><div><br></div><div>Best regards, </div><div><br></div><div>Suguru Katsube</div><div>Kyushu university</div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>○●----------------------------------------------------------●○</div><div>　<font face="arial, sans-serif">勝部　俊（Suguru Katsube）</font></div><div><p style="margin:0px;line-height:normal"><font face="arial, sans-serif"><font color="#000000" size="2">　九州大学大学院</font><span style="color:rgb(0,0,0)">医学系学府保健学専攻</span></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal"><font color="#000000" face="arial, sans-serif"><font size="2">　医用量子線科学分野　修士課程</font><span style="line-height:normal"><font size="2">1</font></span><font size="2">年</font></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal;min-height:14px"><font color="#000000" size="2" face="arial, sans-serif"><br></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal"><font color="#000000" face="arial, sans-serif"><font size="2">　Medical Quantum Radiation Science Course</font><span style="line-height:normal"><font size="2">,</font></span></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal"><font color="#000000" face="arial, sans-serif"><font size="2">　Department of Health Sciences</font><span style="line-height:normal"><font size="2">,</font></span></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal"><font color="#000000" face="arial, sans-serif"><font size="2">　Graduate School of Medical Sciences</font><span style="line-height:normal"><font size="2">,</font></span><font size="2"> </font></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal"><font color="#000000" face="arial, sans-serif"><font size="2">　Kyushu University</font><span style="line-height:normal"><font size="2">,</font></span><font size="2"> Fukuoka</font><span style="line-height:normal"><font size="2">,</font></span><font size="2"> Japan</font></font></p><p style="margin:0px;line-height:normal"><font face="arial, sans-serif"><font size="2"><font color="#000000">　E-mail: </font></font><a href="mailto:E-mail%3Aymmk88kmmy@gmail.com" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">sug.katsu@gmail.com</a></font></p></div><div>○●----------------------------------------------------------●○</div></div></div></div></div></div></div></div></div>