<div dir="ltr"><div>Hello everyone and CasToR team, <br></div><div><br></div><div>I am just a beginner for using CasToR, so I have a simple question <br></div><div>(maybe there is a better mailing list for my question). </div><div><br></div><div>I have CasTOR v.2.1, compiled with a Make file under Linux Mint <br></div><div>with an MPI flag. I try to run a benchmark PET-benchmark-histogram v2, <br></div><div>and I get the following error:</div><div style="margin-left:40px"><br></div><div style="margin-left:40px">==============================================================================================<br>Reconstruction is going on. Should take from one to several minutes depending on the hardware.<br>==============================================================================================<br>sOutputManager::InitOutputDirectory() -> Output path is 'benchmark_pet_histogram_challenger'<br>castor-recon() -> Launch reconstruction from CASToR version 2.1.<br>sScannerManager::BuildScannerObject() -> Start building<br>sScannerManager::InstantiateScanner() -> Instantiate the scanner geometry structure<br>iScannerPET::Instantiate() -> Create scanner structure and read parameters from configuration file<br>sScannerManager::GetGeometricInfoFromDataFile() -> Look for acquisition specific settings into datafile header<br>sScannerManager::BuildLUT() -> Generate the geometric Look-Up Table<br>iScannerPET::BuildLUT() -> Build LUT for scanner elements coordinates and orientations<br>sScannerManager::Initialize() -> From scanner PET_GE_SIGNA_PET-MR<br>iScannerPET::Initialize() -> Initialize remaining stuff for scanner to be ready<br>***** oImageDimensionsAndQuantification::CheckParameters() -> Should provide a strictly positive number of threads !<br>***** The following error message was issued by MPI instance 0<br>***** castor-recon() -> A problem occurred while checking image dimensions parameters !<br>***** Exit function called. Abort with code 1.<br><br>==============================================================================================<br>Check benchmark results (compare reconstructed image with the reference one)<br>==============================================================================================<br>***** Input header file 'benchmark_pet_histogram_challenger_it2.hdr' is missing or corrupted !</div><div><br></div><div>Could one help to find the reason for this error and how to fix it? <br></div><div>I am not sure that MPI is really on. is there is a command to check with witch flags my CasToR <br></div><div>compiled? <br></div><div><br></div><div>Best, <br></div><div>Fedor<br></div><div><br></div></div>