<div dir="ltr">Thank you so much.</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Jul 7, 2020 at 2:21 PM FILIPOVIC PIERUCCI Marina <<a href="mailto:Marina.FILIPOVICPIERUCCI@cea.fr">Marina.FILIPOVICPIERUCCI@cea.fr</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div>
<div style="direction:ltr;font-family:Tahoma;color:rgb(0,0,0);font-size:10pt">
<div>See<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>castor-recon -help-in</div>
<div><br>
</div>
<div>There is the -sens option, to which you should provide the sensitivity image header<br>
</div>
<div style="font-family:"Times New Roman";color:rgb(0,0,0);font-size:16px">
<hr>
<div id="gmail-m_-2724896754453387012divRpF745876" style="direction:ltr"><font size="2" face="Tahoma" color="#000000"><b>De :</b> Hadi Rezaei [<a href="mailto:hrezaei.m.ph@gmail.com" target="_blank">hrezaei.m.ph@gmail.com</a>]<br>
<b>Envoyé :</b> mardi 7 juillet 2020 11:41<br>
<b>À :</b> FILIPOVIC PIERUCCI Marina<br>
<b>Cc :</b> <a href="mailto:castor-users@lists.castor-project.org" target="_blank">castor-users@lists.castor-project.org</a><br>
<b>Objet :</b> Re: [Castor-users] "killed" message after some days run<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">Hi Marina
<div>Thank you for responding.</div>
<div>How can I relaunch it without recomputing sensitivity?  </div>
<div>Thank you</div>
</div>
<br>
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Jul 7, 2020 at 1:57 PM FILIPOVIC PIERUCCI Marina <<a href="mailto:Marina.FILIPOVICPIERUCCI@cea.fr" rel="noopener noreferrer" target="_blank">Marina.FILIPOVICPIERUCCI@cea.fr</a>> wrote:<br>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<div style="direction:ltr;font-family:Tahoma;color:rgb(0,0,0);font-size:10pt">
<div>Hi,</div>
<div><br>
</div>
<div>I would say that the kill should not be directly related to CASToR execution, as the kill is an operation performed by the operating system or the user. Your sensitivity image is really big, which might explain the time, but you can relaunch your recon
 with the computed sensitivity image given in input, so as not to calculate it again.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best</div>
<div><br>
</div>
<div>Marina<br>
</div>
<div style="font-family:"Times New Roman";color:rgb(0,0,0);font-size:16px">
<hr>
<div id="gmail-m_-2724896754453387012gmail-m_5372957909642090899divRpF206986" style="direction:ltr"><font size="2" face="Tahoma" color="#000000"><b>De :</b> Castor-users [<a href="mailto:castor-users-bounces@lists.castor-project.org" rel="noopener noreferrer" target="_blank">castor-users-bounces@lists.castor-project.org</a>]
 de la part de Hadi Rezaei [<a href="mailto:hrezaei.m.ph@gmail.com" rel="noopener noreferrer" target="_blank">hrezaei.m.ph@gmail.com</a>]<br>
<b>Envoyé :</b> mardi 7 juillet 2020 11:17<br>
<b>À :</b> <a href="mailto:castor-users@lists.castor-project.org" rel="noopener noreferrer" target="_blank">
castor-users@lists.castor-project.org</a><br>
<b>Objet :</b> [Castor-users] "killed" message after some days run<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">Dear CASToR users<br>
<div>I ran a program but after some days I found "killed" message and only sensitivity.img has produced. What is the reason for this error? I used CASTOR_v3</div>
<div>Did anyone face the same error? </div>
<div>Thank you</div>
<div>Best,</div>
<div><br>
</div>
<div>./castor-recon -df TBderenzo_df.Cdh -dout TBderenzo -opti MLEM -it 3:10 -th 8 -proj joseph -conv gaussian,4.,4.5,3.5::psf -dim 280,280,1344<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>sOutputManager::InitOutputDirectory() -> Output path is 'TBderenzo'<br>
castor-recon() -> Launch reconstruction from CASToR version 3.0.1.<br>
sScannerManager::Initialize() -> From scanner TBderenzo<br>
oProjectorManager::Initialize() -> Initialize projectors and projection lines<br>
----- Dynamic model: No parameters given - setting diagonal basis functions !<br>
oOptimizerManager::Initialize() -> Initialize optimizer and penalty<br>
oImageConvolverManager::Initialize() -> Initialize image convolvers<br>
oSensitivityGenerator::Launch() -> Start the sensitivity computation<br>
</div>
<div> --> Time spent for sensitivity generation | User: 276500 sec | CPU: 2.1842655e+06 sec<br>
sChronoManager::Initialize() -> Initialize all duration counters for profiling<br>
vAlgorithm::IterateCPU() -> Start algorithm for 3 iterations<br>
vAlgorithm::IterateCPU() -> Start iteration 1/3 subset 1/10<br>
</div>
<div>killed</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div>